Phòng Vật lý sinh học

Hướng nghiên cứu chính

Nghiên cứu cấu trúc, chức năng và sự tương tác của các phân tử sinh học quan trọng như protein, gene, và màng tế bào. Thiết kế thuốc nhắm mục tiêu để ức chế các yếu tố tiềm năng như peptide Amyloid beta, neuraminidase, Mpro của virus SARS-CoV-2, … Đồng thời, xây dựng và cải tiến các thuật toán, mô hình và phần mềm nhằm hỗ trợ phân tích dữ liệu, mô phỏng và dự đoán các quá trình sinh học.

Danh sách các thành viên

STT	Họ và tên	Vị trí	Liên hệ
1	TS. Ngô Sơn Tùng	Trưởng nhóm	ngosontung@tdtu.edu.vn
2	PGS.TS. Lã Đức Dương	Giáo sư danh dự	laducduong@tdtu.edu.vn
3	TS. Nguyễn Trung Hải	Nghiên cứu viên	nguyentrunghai@tdtu.edu.vn
4	TS. Lê Thị Kim Dung	Thành viên chủ chốt	lethikimdung2@tdtu.edu.vn
5	TS. Lê Nguyễn Minh Thông	Thành viên	lenguyenminhthong@tdtu.edu.vn
6	TS. Lưu Xuân Cường	Thành viên	luuxuancuong@tdtu.edu.vn
7	TS. Trương Ngọc Hùng	Postdoc	truongngochung@tdtu.edu.vn
8	TS. Phạm Thị Thu Thảo	Postdoc	phamthithuthao@tdtu.edu.vn
9	ThS. Đỗ Anh Tuấn	Thành viên	doanhtuan@tdtu.edu.vn
10	CN. Thái Quỳnh Mai	Thành viên	thaiquynhmai@tdtu.edu.vn

Nhiệm vụ khoa học đang thực hiện:

1. Nghiên cứu các hợp chất hướng ức chế AChE hỗ trợ điều trị bệnh sa sút trí tuệ sử dụng kết hợp mô hình máy học (ML), mô phỏng động lực học phân tử, và thử nghiệm trong ống nghiệm (Sở KHCN Tp. Hồ Chí Minh).

Nhiệm vụ khoa học hoàn thành:

1. Nghiên cứu khả năng ức chế AChE của các hợp chất chiết xuất từ tinh dầu hạt Neem bằng công cụ máy tính (Công ty Cổ phần quốc tế AOTA).

2. Nghiên cứu ảnh hưởng của đột biến vùng lõi kỵ nước trên cấu trúc của các tiền sợi Aβ sử dụng mô phỏng đông học phân tử trao đổi mô hình (NAFOSTED).

Công bố tiêu biểu:

	Quynh Mai Thai, Nguyen Thanh Tung, Dung Do Thi Mai, Son Tung Ngo, Dimerization of the Aβ42 under the Influence of the Gold Nanoparticle: A REMD Study. J. Phys. Chem. B 2024, 128, 47, 11705–11713. (Q1, IF: 2.8)
	Thi-Kim-Dung Le, Thuc-Huy Duong, Warinthorn Chavasiri. Chemical constituents with their alpha-glucosidase inhibitory activity from the whole plant of Ceratophyllum demersum. Phytochemistry. 2025, 229, 114290 (Q1, IF: 3.2)
	Phuong Nguyen, Ayyalusamy Ramamoorthy, Bikash Sahoo, Jie Zheng, Peter Faller, John Straub, Laura Domínguez, Joan-Emma Shea, Nikolay Dokholyan, Alfonso De Simone, Buyong Ma, Ruth Nussinov, Saeed Najafi, Son Tung Ngo, Antoine Loquet, Mara Chiricotto, Pritam Ganguly, James McCarty, Mai Suan Li, Carol Hall, Yiming Wang, Yifat Miller, Simone Melchionna, Birgit Habenstein, Stepan Timr, Jiaxing Chen, Brianna Hnath, Birgit Strodel, Rakez Kayed, Sylvain Lesne, Guanghong Wei, Fabio Sterpone, Andrew Doig, Philippe Derreumaux, Amyloid Oligomers: A Joint Experimental/Computational Perspective on Alzheimer’s Disease, Parkinson’s Disease, Type II Diabetes and Amyotrophic Lateral Sclerosis. Chem. Rev. 2021, 121, 2545–2647. (Q1, IF: 51.5)

Công bố mới:

	Quynh Mai Thai, Trung Hai Nguyen, George Binh Lenon, Huong Thi Thu Phung, Jim-Tong Horng, Phuong-Thao Tran, Son Tung Ngo. Estimating AChE inhibitors from MCE database by machine learning and atomistic calculations. J. Mol. Graph. Model. 2025, 134, 108906. (Q2, IF: 2.7)
	Pham Thi Thu Thao, Dinh Quy Huong, Nguyen Minh Thong, Mai Van Bay, Son Tung Ngo, Quan Van Vo, Pham Cam Nam. Revisiting the radical trapping activity of N–H and O–H in N-phenylhydroxylamine: a DFT study. Phys. Chem. Chem. Phys. 2025, 27, 8457-8466 (Q2, IF: 3.7)
	Tran Thi Hoai Van, Minh Quan Pham, Truong Thi Thu Huong, Bui Nguyen Thanh Long, Pham Quoc Long, Le Thi Thuy Huong, George Binh Lenon, Nguyen Thi Thanh Uyen, Son Tung Ngo. Searching potential GSK-3β inhibitors from marine sources using atomistic simulations. Mol. Divers. 2025 (Q2, IF: 3.9)
	Quynh Mai Thai, Huong TT Phung, Nguyen Thanh Tung, Linh Hoang Tran, Son Tung Ngo. Assessing the ligand-binding affinity of chitinase inhibitors using steered-molecular simulations. Chem. Phys. Lett. 2025, 864, 141899. (Q2, IF: 2.8)
	Thong Nguyen-Minh Le, Thong Le Minh Pham, Thang Bach Phan, Yoshiyuki Kawazoe. Stabilization of small organic molecules on V₂C and V₂CO₂ MXenes: first-principles insights into the performance of van der Waals functionals and the effect of oxygen vacancies. RSC Adv. 2025, 15, 301-311. (Q1, IF: 3.9)